Dalam melaksanakan tugas, BBPOPT menyelenggarakan fungsi:

1. 1. Penyusunan rencana program dan anggaran, serta evaluasi dan pelaporan;
   2. Pelaksanaan analisis data dan informasi hasil pengamatan serangan dan faktor penentu perkembangan organisme pengganggu tumbuhan;
   3. Penyusunan hasil pengamatan, peramalan, dan pengendalian organisme pengganggu tumbuhan;
   4. Penyusunan dan penguatan metode pengamatan, peramalan, dan pengendalian organisme pengganggu tumbuhan;
   5. Pemantauan dan evaluasi pelaksanaan pengamatan, peramalan, dan pengendalian organisme pengganggu tumbuhan;
   6. Pelaksanaan bimbingan teknis pengamatan, peramalan dan pengendalian organisme pengganggu tumbuhan serta penerapan sistem manajemen mutu laboratorium uji perlindungan tanaman pangan dan hortikultura;
   7. Pemberian pelayanan kegiatan pengamatan, peramalan, pengendalian organisme pengganggu tumbuhan, dan rujukan perlindungan tanaman pangan dan hortikultura;
   8. Pelaksanaan urusan tata usaha dan rumah tangga Balai Besar Peramalan OPT.