Dalam melaksanakan tugas, BBPOPT menyelenggarakan fungsi:

1. 1. Penyusunan program dan evaluasi peramalan, pengembangan peramalan OPT, dan rujukan perlindungan tanaman pangan dan hortikultura;
   2. Pelaksanaan analisis data dan informasi serangan OPT, dan faktor penentu perkembangan OPT;
   3. Pelaksanaan dan penyusunan perumusan peramalan, pengamatan, dan pengendalian OPT;
   4. Pelaksanaan pengkajian dan pengembangan teknologi peramalan, pengamatan, dan pengendalian OPT berdasarkan sistem pengendalian hama terpadu;
   5. Pelaksanaan pemantauan dan evaluasi penerapan teknologi peramalan, pengamatan, dan pengendalian OPT;
   6. Pelaksanaan pemantauan dan evaluasi penerapan sistem manajemen mutu laboratorium uji di bidang perlindungan tanaman;
   7. Pelaksanaan pemberian bimbingan teknis peramalan, pengamatan, dan pengendalian OPT;
   8. Pemberian pengembangan pelayanan peramalan kegiatan OPT, peramalan, rujukan dan perlindungan tanaman pangan dan hortikultura;
   9. Pelaksanaan tata usaha dan rumah tangga Balai Besar POPT.